Bakalárske práce
Aktivita lakáz produkovaných vláknitými hubami bielej hniloby s využitím polosuchej kultivácie na rôznych lignocelulózových materiáloch / Activity of laccase produced by white-rot fungi using solid state cultivation on different lignocellulosic materials
Školiteľ: doc. RNDr. Daniela Ondrejovič Chmelová, PhD. (daniela.ondrejovic.chmelova@ucm.sk)
Školiace pracovisko: Oddelenie biotechnológií, ÚBB, FPV, UCM v Trnave
Anotácia: Cieľom bakalárskej práce bude spracovanie literárneho prehľadu zameraného na produkciu lakáz vláknitými hubami bielej hniloby. Lakázy (laccases, EC 1.10.3.2) predstavujú významné enzýmy, patriace medzi oxidoreduktázy, ktoré je možné využiť v bioremediačných technológiách pri odstraňovaní rôznych polutantov prítomných v životnom prostredí. Tieto enzýmy môžu byť produkované množstvom organizmov, pričom najvýznamnejšími producentmi sú práve vláknité huby bielej hniloby ako napríklad rody Pleurotus, Trametes a Pycnoporus. V literárnej rešerši sa zameriame na producentov lakáz patriacich medzi vláknité huby bielej hniloby a možnosti zefektívnenia ich kultivácie pre zvýšenie produkcie a enzýmovej aktivity lakáz, v experimentálnej časti práce otestujeme možnosť produkcie lakáz vláknitými hubami bielej hniloby a porovnáme aktivity týchto enzýmov produkovaných v podmienkach polosuchej kultivácie s využitím rôznych lignocelulózových materiálov.
Kľúčové slová: lakázy, vláknité huby, enzýmy, kultivácia
Rastlinné inhibítory proteináz GIT človeka / Plant inhibitors of human GIT proteinases
Školiteľ: prof. RNDr. Miroslav Ondrejovič, PhD. (miroslav.ondrejovic@ucm.sk)
Školiace pracovisko: Oddelenie biotechnológií, ÚBB, FPV, UCM v Trnave
Anotácia: Proteinázy gastrointestinálneho traktu (GIT) hrajú významnú úlohu tak v procesoch rozkladu potravy na základné zložky využívané našim organizmom pre budovanie vlastného proteómu ako aj v špecifických ochoreniach danej časti ľudského organizmu. Keďže samotný GIT je tvorený proteínmi, ktoré môžu byť poškodené danými enzýmami, náš organizmus disponuje endogénnymi mechanizmami, ktorými sa limituje ich negatívny vplyv na naše tkanivá. Avšak vstupom exogénnych látok pochádzajúcich z potravy a tvorbou proteáz inými organizmami kolonizujúcimi náš GIT môže dochádzať k porušeniu danej rovnováhy, čím nastávajú komplikácie pre daný organizmus. Preto cieľom tejto bakalárske práce bude štúdium vplyvu vybraných nízko- a vysoko-molekulových látok pochádzajúcich z rastlín na aktivitu proteináz nachádzajúcich sa v našom GIT. V experimentálnej časti práce sa budeme venovať stanoveniu inhibičnej aktivity látok definovaných v literatúre ako inhibítory rastlinného pôvodu potenciálne účinné voči proteázam GIT.
Kľúčové slová: gastrointestinálny trakt, proteázy, inhibítory
Produkcia polyhydroxyalkanoátov pomocou metanotrofných baktérií/ Production of polyhydroxyalkanoates by methanotrophic bacteria
Školiteľ: prof. RNDr. Miroslav Ondrejovič, PhD. (miroslav.ondrejovic@ucm.sk)
Školiace pracovisko: Oddelenie biotechnológií, ÚBB, FPV, UCM v Trnave
Anotácia: Polyhydroxyalkanoáty predstavujú skupinu biodegradovateľných polymérov, ktoré majú technologické vlastnosti podobné konvenčným plastom. I keď ich produkcia je známa už niekoľko desaťročí, na efektívnu náhradu konvenčných plastov je potrebné znížiť náklady na ich výrobu. Jednou zo skupín producentov sú metanotrofné baktérie schopné akumulovať tento polymér z mnohých vedľajších produktov vznikajúcich pri priemyselnej činnosti (vrátane alkoholov, kyselín a dokonca uhľovodíkov). Preto cieľom tejto bakalárskej práce bude vytvoriť prehľad zameraný na podmienky produkcie daných polymérov metanotrofnými baktériami. V rámci experimentálnej práce sa budú hodnotiť odporúčané spôsoby kultivácie daných baktérií vyplývajúce z literárneho prehľadu v kontexte tvorby bunkovej biomasy a akumulacie intracelulárnych zásob PHA.
Kľúčové slová: polyhydroxyalkanoáty, metanotrofné baktérie, polyhydroxybutyrát, bioplasty
Detekcia metalotioneínu ako významného faktoru pri tolerancii a remediácii ťažkých kovov rastlinami/ Detection of metalthionein as an important factor in the tolerance and remediation of heavy metals by plants
Školiteľ: prof. Mgr. Daniel Mihálik, PhD. (daniel.mihalik@ucm.sk)
Školiace pracovisko: Oddelenie biotechnológií, ÚBB, FPV, UCM v Trnave, Národné poľnohospodárske a potravinárske centrum, Výskumný ústav rastlinnej výroby, Piešťany
Anotácia: Metalotioneíny (MT) sú intracelulárne, na cysteín bohaté metaloproteíny s nízkou molekulovou hmotnosťou prítomné vo všetkých živých organizmoch okrem archaea. Rastlinné MT sú spojené s množstvom fyziologických procesov, akými sú homeostáza kovových iónov, detoxikácia prebytočných kovov a ochrana pred oxidačným stresom. Práca bude pozostávať z vypracovania literárneho prehľadu zameraného na fytoremediácie a fytochelatačné proteíny s afinitou na ťažké kovy, popisu techník imunochemickej detekcie a praktická časť bude zameraná na kultiváciu rastlinného materiálu, vystaveniu rastlín stresom ťažkým kovom, izoláciou proteomickej frakcie, elektroforetickej separácii proteínov a napokon imunochemickej detekcie metaltioneínu špecifickou komerčne dostupnou protilátkou. Cieľom práce bude detekcia týchto proteínov pri rastlinách vystavených účinkom ťažkých kovov.
Kľúčové slová: metaltioneín, imunochemická detekia, ťažké kovy
Založenie kalusových kultúr levandule lekárskej (Lavandula angustifolia Mill.) s tvorbou kmeňových buniek / Establishment of English lavender (Lavandula angustifolia Mill.) callus cultures with the formation of stem cells
Školiteľ: prof. RNDr. Ján Kraic, PhD. (jan.kraic@ucm.sk)
Konzultantka: RNDr. Šarlota Kaňuková, PhD.
Školiace pracovisko: Oddelenie biotechnológií, ÚBB, FPV, UCM v Trnave
Anotácia: Cieľom bakalárskej práce bude spracovanie literárneho prehľadu o problematike založenia kalusových kultúr levandule lekárskej a analýzy tvoriacich sa kmeňových buniek.
Študent/ka využije tieto teoretické vedomosti v experimentálnej časti, ktorá bude zameraná na: i) založenie in vitro kalusových kultúr z rôznych typov explantátov levandule lekárskej, ii) charakterizovanie kalusov a vyhodnotenie procesu kalogenézy, iii) histologické a cytologické analýzy typov buniek v kalusoch.
(Experimentálna činnosť bude vykonávaná hlavne vo VÚRV Piešťany).
Kľúčové slová: levandula, kalus, kmeňové bunky
Produkcia kalusovej bunkovej biomasy levandule prostrednej (Lavandula × intermedia) in vitro/ In vitro production of callus cell biomass of hybrid lavender (Lavandula × intermedia)
Školiteľka: RNDr. Šarlota Kaňuková, PhD. (sarlota.kanukova@ucm.sk)
Konzultant: prof. RNDr. Ján Kraic, PhD.
Školiace pracovisko: Oddelenie biotechnológií, ÚBB, FPV, UCM v Trnave
Anotácia: Cieľom bakalárskej práce bude spracovanie literárneho prehľadu o problematike založenia kalusových kultúr a produkcie kalusovej biomasy levandule prostrednej.
Študent/ka využije tieto teoretické vedomosti v experimentálnej časti, ktorá bude zameraná na: i) založenie in vitro kalusových kultúr z rôznych typov explantátov levandule prostrednej, ii) vyhodnotenie procesu kalogenézy a morfologické charakterizovanie kalusov, iii) kvantitatívne vyhodnotenie nárastu kalusovej biomasy.
(Experimentálna činnosť bude vykonávaná hlavne vo VÚRV Piešťany).
Kľúčové slová: levandula prostredná, kalus, biomasa
Indukcia kalogenézy pri vybraných druhoch aksamietnice (Tagetes sp.) / Induction of callogenesis in selected marigold species (Tagetes sp.)
Školiteľka: RNDr. Šarlota Kaňuková, PhD. (sarlota.kanukova@ucm.sk)
Konzultant: prof. RNDr. Ján Kraic, PhD.
Školiace pracovisko: Oddelenie biotechnológií, ÚBB, FPV, UCM v Trnave
Cieľom bakalárskej práce bude spracovanie literárneho prehľadu o problematike založenia kalusových kultúr pri vybraných druhoch aksamietnice a možnostiach in vitro produkcie sekundárnych metabolitov aksamietnice.
Študent/ka využije tieto teoretické vedomosti v experimentálnej časti, ktorá bude zameraná na: i) založenie in vitro kalusových kultúr z rôznych rôznych typov explantátov vybraných druhov aksamietnice, ii) testovanie rôznych rastových regulátorov na proces kalogenézy, iii) charakterizovanie kalusov a vyhodnotenie kalogenézy.
(Experimentálna činnosť bude vykonávaná hlavne vo VÚRV Piešťany).
Kľúčové slová: aksamietnica, kalus, rastové regulátory
Vplyv biotických elicitorov na kalogenézu durmanu obyčajného (Datura stramonium L.) / Effect of biotic elicitors on callogenesis of thornapple (Datura stramonium L.)
Školiteľka: RNDr. Šarlota Kaňuková, PhD. (sarlota.kanukova@ucm.sk)
Konzultant: prof. RNDr. Ján Kraic, PhD.
Školiace pracovisko: Oddelenie biotechnológií, ÚBB, FPV, UCM v Trnave
Cieľom bakalárskej práce bude spracovanie literárneho prehľadu o problematike založenia kalusových kultúr durmanu obyčajného kultúr, elicitácie, biotických elicitorov, aplikácie elicitorov v in vitro kultúrach rastlín a možnostiach elicitácie produkcie sekundárnych metabolitov durmanu obyčajného.
Študent/ka využije tieto teoretické vedomosti v experimentálnej časti, ktorá bude zameraná na: i) založenie in vitro kalusových kultúr z rôznych explantátov durmanu, s testovaním rôznych rastových regulátorov, ii) výber a aplikovanie vybraných biotických elicitorov do kalusových kultúr, iii) vyhodnotenie vplyvu biotických elicitorov na proces kalogenézy a na tvorbu a vlastnosti kalusov, prípadne až produkciu tropánových alkaloidov.
(Experimentálna činnosť bude vykonávaná hlavne vo VÚRV Piešťany).
Kľúčové slová: durman obyčajný, kalus, elicitácia, biotický elicitor, tropánové alkaloidy
Vplyv abiotických elicitorov na kalogenézu durmanu obyčajného (Datura stramonium L.) / Effect of abiotic elicitors on callogenesis of thornapple (Datura stramonium L.)
Školiteľka: RNDr. Šarlota Kaňuková, PhD. (sarlota.kanukova@ucm.sk)
Konzultant: prof. RNDr. Ján Kraic, PhD.
Školiace pracovisko: Oddelenie biotechnológií, ÚBB, FPV, UCM v Trnave
Cieľom bakalárskej práce bude spracovanie literárneho prehľadu o problematike založenia kalusových kultúr durmanu obyčajného, elicitácie, abiotických elicitorov, aplikácie elicitorov v in vitro kultúrach rastlín a procese elicitácie produkcie sekundárnych metabolitov.
Študent/ka využije tieto teoretické vedomosti v experimentálnej časti, ktorá bude zameraná na: i) založenie in vitro kalusových kultúr z rôznych explantátov durmanu, s testovaním rôznych rastových regulátorov, ii) výber a aplikovanie vybraných abiotických elicitorov do kalusových kultúr, iii) vyhodnotenie vplyvu abiotických elicitorov na proces kalogenézy a tvorbu a vlastnosti kalusov, prípadne až produkciu tropánových alkaloidov.
(Experimentálna činnosť bude vykonávaná hlavne vo VÚRV Piešťany).
Kľúčové slová: durman obyčajný, kalus, elicitácia, biotický elicitor, tropánové alkaloidy
Klíčenie ako nástroj na zvýšenie nutričnej hodnoty semena strukoviny / Germination as a tool to increase the nutritional value of legumes seed
Školiteľ: doc. RNDr. Michaela Havrlentová, PhD. (michaela.havrlentova@ucm.sk)
Školiace pracovisko: Oddelenie biotechnológií, ÚBB, FPV, UCM v Trnave + NPPC – Výskumný ústav rastlinnej výroby v Piešťanoch
Anotácia: Cieľom bakalárskej práce bude vypracovať literárny prehľad zameraný na význam strukovín a vplyv klíčenia na nutričnú kvalitu semena strukoviny v humánnej výžive. Z hľadiska prieskumu vedeckej literatúry bude pozornosť venovaná vybraným nutričným (bielkoviny, potravinová vláknina, škrob, minerálne prvky a podobne) a antinutričným (kyselina fytová, vybrané sekundárne metabolity) parametrom. Experimentálna časť práce bude zameraná na vplyv doby klíčenia na obsah vybraných metabolitov v semene a aktivitu vybraných enzýmov. V suchom semene a semene klíčenom po rôznu dobu bude sledovaný obsah bielkovín, vybraných zložiek potravinovej vlákniny, lipidov, škrobu a vybraných minerálnych prvkov a aktivita vybraných enzýmov ako sacharáza, lipáza a podobne.
Kľúčové slová: strukoviny, výživa, nutričná hodnota, klíčenie, aktivita enzýmov
Transgenóza ako nástroj na zvýšenie tolerancie rastlín voči ťažkým kovom/ Transgenosis as a tool for increasing plant tolerance to heavy metals
Školiteľ: doc. Ing. Jana Moravčíková, PhD (jana.moravcikova@ucm.sk)
Školiace pracovisko: Oddelenie biotechnológií, ÚBB, FPV, UCM v Trnave
Anotácia: Abiotický stres predstavuje vážnu hrozbu pre udržateľnosť výnosov plodín. Využitie moderných nástrojov molekulárnej biológie otvára nové možnosti ako sa vysporiadať s týmto problémom. Genetické inžinierstvo rastlín zamerané na zvýšenie odolnosti rastlín voči abiotickému stresu je založené na vnesení génov, o ktorých je známe, že sú súčasťou obrannej reakcie. Expresia takýchto génov v transgénnych rastlinách zvyšuje ich toleranciu v podmienkach príslušného abiotického stresora. Cieľom bakalárskej práce bude spracovať literárny prehľad týkajúci sa problematiky abiotického stresu spôsobeného ťažkými kovmi, jeho dopadu na rastliny a doposiaľ uplatnené stratégie. Zároveň práca prinesie prehľad o aplikácii týchto poznatkov v praxi. V experimentálnej časti otestujeme efekt konštitutívnej expresie dehydrínového génu v transgénnych rastlinách tabaku na klíčenie transgénnych semien v prítomnosti zvýšenej koncentrácie medi.
Kľúčové slová: geneticky modifikované rastliny, stres, ťažké kovy
